1511年2月，大征服者阿尔布克尔克决定挥师东方的马六甲城，暂时离开自己的果阿新基地。这一举动不仅导致果阿的葡萄牙驻军数量锐减，还给贾布尔苏丹创造了利好机会。贾布尔苏丹随即发动数万大军，开始对昔日掌上明珠之城全面进攻。

果阿城内只有400名葡萄牙士兵，面对如排山倒海般袭来的穆斯林军队无力抵挡。尽管老盟友提摩吉曾被认定为国王，但由于其出身较低，很难得到本地印度教社会的认可。因此，在奥斯曼大将普拉德汗率领的围攻大军抵达前，提摩吉被更高贵出身的梅尔劳取代。然而，这也意味着葡萄牙失去了许多能够协助他们作战的海盗群体。因此，除了坚固的城防，他们没有更好的应对方法。

果阿城墙是按照欧洲标准重建的，设计得十分坚固，可以让少量守军填补大部分射击盲区，使进攻方难以找到合适的突破口。然而，印度军队也遇到了问题。奥斯曼志愿兵和波斯雇佣兵因为伤亡惨重，无法独立作战。进攻方的火力因此受到削弱，不得不更多地依赖传统兵种，如突厥裔骑兵和印度教征召步兵的中世纪武装。尽管葡萄牙士兵很少遭遇突厥系骑兵，但在几次野战中仍然处于下风。加之大部分海军舰船被调往马六甲作战，使得防守方失去了任何非对称优势。

这些城墙是由建筑师托马斯-费尔南德设计的欧式棱堡结构，有利于少量守军填补大部分射击盲区。果阿的葡萄牙士兵充分利用这些堡垒和防御工事，进行顽强的抵抗。城内的巷战和街头激战使奥斯曼军队付出了惨重的代价。
这场果阿的战役标志着葡萄牙殖民帝国在印度洋的势力衰落。尽管葡萄牙在此后几十年内仍然在印度洋地区有殖民地，但它们逐渐失去了对该地区的控制。奥斯曼帝国和其他欧洲殖民势力在印度洋地区的竞争日益激烈，为该地区的地缘政治格局带来了深远影响。