身为哺乳动物里的“异类”，蝙蝠应该说是凭借自身的力量，硬是在鸟的天空里，闯出一片天，然而时至今日，蝙蝠的始祖到底是何许人也，这一疑问，仍未得到解决。
民间传说蝙蝠的始祖就是老鼠，但其实尽管蝙蝠不会飞、匍匐前进似乎确实与老鼠有些类似，但其实它们根本就没有联系。

时至今日，还没有哪种古生物化石能显示蝙蝠祖先身份，即使蝙蝠到底产生于何期这一问题仍不得而知。
有人认为蝙蝠大概是恐龙时代的产物。而且根据化石分析发现，与蝙蝠相似的翼手目生物确实是在距今8000万年的白垩纪晚期才出现，然而这并不表明蝙蝠在此时才出现，毕竟蝙蝠直系祖先向蝙蝠演化，还有很长的路要走。
报道称，一个欧洲科学家小组近日经过对埃及果蝠，大鼠耳蝠，库氏伏翼蝠和獒蝠等蝙蝠的科学研究发现，蝙蝠祖先为回声定位能力强的生物，向蝙蝠进化时其听力基因得到最大限度地保存，并在进化中不断得到完善，从而成为蝙蝠“超能力”的一部分。
因此，在科学家看来，全面认识蝙蝠抗病毒机制并掌握其病毒传播机制将有助于人类在源头上避免受到蝙蝠所带病毒的感染，还能通过DNA研究进行比对为人类提供一个与蝙蝠相似的超强免疫系统提供契机。
说来人类对蝙蝠一直心怀鬼胎，其理由非常简单，那是因为蝙蝠一直在散布病毒并屡屡给人类世界造成灾难。但其实自然界任何生物的出现都是有其原因的，此次科学家将蝙蝠优质基因组公布于众，是我们对蝙蝠研究的一个良好突破，以后人类与蝙蝠还有机会实现和平共处。