在民间传说中，有花瓣形指甲的人与明代山西移民的历史事件有关，是山西移民的后裔。据说元朝末年，战乱不断，饥荒遍地，而山西的地形很少受外界干扰，很多老百姓都跑到那里躲避。朱元璋建立明朝后，为了恢复中原地区的农业生产，命令山西的一部分人迁徙到人烟稀少的地方开荒种田。

为了防止移民逃跑，官兵们用刀切开小脚趾，把指甲分成两瓣，以此来标记山西移民；同时也方便移民的后代回乡认祖归宗。根据这个历史故事，民间也写下了“谁是古槐的仆人，两脚脚趾查钉形”的说法。乍一看这种说法很有道理，但是指甲上有刀痕的说法是没有科学依据的。原因很简单。外力造成的疤痕不是基因，不会遗传给后代，所以花瓣状指甲的人是山西移民后代的说法自然不成立。事实上，网上说花瓣形指甲是某个民族或某个群体后代特有的，可以用“外国人也有花瓣形指甲”这句话来反驳。
既然花瓣状指甲不是某个民族或群体的固有特征，那它是怎么来的，目前主流合理的理论是发生论。遗传就是人类在进入工业社会之前，经历了几千年的农耕生活。在长期的农业劳动中，脚趾甲经常与外界环境发生摩擦。因为脚趾甲是最脆弱的，在长期的摩擦中开裂，变成两瓣甚至三瓣。
这种不起眼的变化在漫长的历史演变中逐渐成为稳定的遗传性状，然后一直传承至今。一般来说，花瓣状指甲的人没有什么特殊的起源，只是一种简单的遗传现象。
由于显性遗传，中国约60%的人有花瓣状指甲，然而遗传可能不是脚趾甲开裂的真正原因，只是科学家对现有研究做出的最合理的猜测。因为花瓣状的指甲对生命健康没有影响，所以科学家没有深入研究。毕竟就算说清楚了，意义也不大。