李世民在发动政变之后杀死了两个兄弟，为斩草除根，将其兄弟的十个儿子杀害了，并没有杀掉18个侄子。众所周知，李世民与李建成和李元吉之间的矛盾是非常深的。李世民明白，想要成功夺得皇权，就必须将李建成和李元吉背后的势力铲除干净。将整个家族连根拔起的重要一步就是杀掉他们的孩子，避免他们继续与残余势力勾结，卷土重来。

发动玄武门之变的前夕，李世民已经动了彻底杀掉李元吉和李建成的心思，夺位之战的形势逐渐险峻，已经到了你死我活的地步。因此，李世民先骗在外居住的李元吉和李建成入宫，并且经过玄武门。李世民的部队极为精良，作战力极强，他们埋伏在玄武门两边，甚至还与驻守在玄武门的将军有所勾结。

李元吉和李建成骑着马，经过玄武门时，李世民便用箭射死了李建成。李世民的忠诚良将尉迟恭可谓是李元吉的天敌，也将李元吉斩杀。齐王和太子李建成背后的势力依然很大，李世民于是向这些人称是李渊命令他杀掉太子和齐王的，并且美其名曰两人都有谋反的念头。主帅大权旁落，两人旗下的诸多大将也纷纷向李世民投降。

而李渊得知李世民的所作所为之后，也明白李世民发动政变是不可避免的，即使其能够阻止这次事故，也没有办法阻止下一次的政变。于是李渊便干脆承认了李世民的说法，称太子和齐王的确谋反。在杀掉王和太子后，李世民仍不满足，还杀掉了李建成和李元吉的十个儿子。

李渊将不少国家权力都分配给了各位皇子，而李世民虽然不是太子，其手下却是有着掌握国家经济命脉的铸币权，这些权力都成为了李世民政变的资本。李渊手中的权力渐少，实力渐微，无法与李世民强大的实力背景相抵抗，这正是李渊为什么不阻止玄武门之变的原因，他手中的权力微弱不如李世民。于是就在太子和齐王被李世民杀害不久之后，李渊退位，李世民便名正言顺的成为继承皇位最合法的皇子。