窦姓的起源分为三个，一是源自姒姓，来自于禹的玄孙姒少康的母亲后缗的避难之地，当时少康为了纪念他的出生地-窦，就将自己的两个儿子取姓为窦。二是源自周穆王的皇后姓氏，当时被赐予窦姓。三是源自姬姓，源自战国时期魏国的大夫窦公，原姓为窦公氏，后简化为窦氏。

1. 源自姒姓

舜帝当时因禹治水成功而赐名他为姒姓，而大禹后代太康的儿子少康则是窦姓的始祖，据说太康在位的时候非常的享受玩乐，而不是勤理朝政，使得有穷氏部落的首领羿非常的看不惯他，于是在太康和妃子后缗外出游玩的时候，将他们堵在了黄河北岸。

后缗当时在洛水转弯处的一个洞穴中等待太康，但是足足等了一百天也没人来，后来被有穷氏族人发现，只能躲藏在窦之中，而后缗当时已经快要临盆，于是就逃出来投奔了任氏，最终生下了少康，少康为了纪念这个事件，于是将自己儿子中的两个取姓为窦，一直延续至今。

2. 源自姬姓

战国时期的魏国大夫窦公就是姬姓窦氏的始祖，当时他的后人都是以“窦公”为氏的，但是后来随着时间的推移，他们就将姓氏越来越简化，最终形成了窦姓。

3. 源自周穆王赐姓

根据《穆天子传奇》中记载的可以得知，周穆王当时赏赐皇后氏族为窦姓，所以她的家族后代也成为了窦姓的一脉。

4. 源自少数民族改姓

与赵姓起源和来历一样，窦姓中也有不少是源自少数民族改姓而来，比如鲜卑族中的娄提氏就改姓为窦，还有满族的乌扎喇氏也是一样，当然其中还包括蒙古族、锡伯族等，基本都是汉化姓氏而来的，基本上都是北魏时期改名最多。