祁姓最古老的源头可以追溯到黄帝时期，黄帝在位时将自己的十四个儿子赐姓了不同的十二个姓氏，其中祁叔就以祁为姓，因此祁姓也成为了最古老的姓氏之一。祁姓还有部分是源自“祁父”这个官职名，主要在西周时期是掌管兵甲的军事官吏，后代也就以祁为姓。

1. 源自黄帝

在上古时期，黄帝就生下了二十五个儿子，其中有是四个儿子是不与他同姓的，都是被他赐予了姓氏的，黄帝当时一共赐予了十二个姓氏，其中就包括了祁姓，而这一脉也成为了祁姓中最正宗且最古老的一个分支。

2. 源自周朝官吏名

周朝时期有一个官职名叫做“祁父”，主要负责掌管军中的兵甲，属于军事统帅，但也有人说还有一种叫做祁人的称呼，因为“祁”在古时候主要是指犯了重罪但是没有判死刑的犯人，所以这些人的后代也可能是以祁为姓，还有军事官吏“祁父”的后代也是如此，为祁姓的一脉。

3. 源自祁奚

不过大部分祁姓族人都是公认祁奚是他们的得姓始祖，在春秋时期的晋国，晋献侯的第四代孙奚受封于祁地，最终他也就被人称为祁奚，而他的后代也就以祁为姓了，据说祁姓还分化出了祁成氏、祁射氏等多个分支氏族，不过祁姓才是祁奚的正宗后裔。

4. 源自石祁子

春秋时期还出了一个卫国大夫叫做石祁子，他的后裔也是祁姓氏族的一脉，子孙主要是以先祖的名为姓，最终世代传承。当然与赵姓起源和来历一样，祁姓中也有不少是源自少数民族改姓的，比如回族中的祁姓族人都是由明太祖赐姓而来，主要源自当时驻守在祁连山地区的军队首领。